То что сделать подобное сторонним софтом типо AHK я понимаю, хотелось бы чтобы сразу в эмуляторе было
Правильный вопрос: как добавить нажатие на одну кнопку двух виртуальных в
Mesen, потому что это лучший эмулятор и нет смысла искать другой эмулятор по такой простой причине. К счастью, там можно это сделать (скачать
https://www.mesen.ca, он обновляется постоянно, просто заменяйте Mesen.exe), в настройках NES > Input > Setup, в Controller Configuration для одного контроллера 4 набора кнопок, если в одном Key Set на B поставить Enter, а на другом Key Set на A поставить тоже Enter, то на Enter будут нажиматься две кнопки.
UPD: Также
BizHawk умеет, там много эмулируемых платформ и ядер (для NES 3 ядра, полезных 2), в настройках можно на одну виртуальную кнопку установить несколько, если отключить Auto Tab внизу.