вообще отвал SPU, GPU, да и вообще всего чего только можно, это уже стандартная проблема, годы берут своё, припой деградирует.
что касается возврата к приводу для проверки, то смысла особого нет, малина гонит данные по I2S синхронизируясь по субкодам (подсистему поиска в расчёт не берём, она не участвует в моменты линейного чтения), если бы проблема была в этом, то не грузились бы игры вообще, а у тебя нет никаких проблем с этим.
вообще для DSP (следовательно и для picostation) вообще нет разницы что передавать по I2S в CDROM CONTROLER, для них это всегда один и тот же поток с одним и тем же размером, и не может быть такого что видеоролик или игровые данные грузятся, а звук нет.