Странно, что срабатывает именно вверх, т.к. до неё по этой же линии считываются A, B, select и start. Если бы все были в состоянии 1, то ставилась бы пауза. У меня было нечто похожее, когда я забывал выткнуть из порта расширения устройства. Но в вашем случае, если не вставлен второй контроллер, то дело в чипе приставки, и тут уже ничего не сделаешь.
